Ηταν ένας εκ των σταθερότερων και πλέον πολύτιμων ποδοσφαιριστών του Ολυμπιακού (και) τη σεζόν που πέρασε, αν και αρνητικός πρωταγωνιστής στον τελικό του εγχώριου Κυπέλλου όταν έσπευσε να πείσει τους διαιτητές ότι δεν έκανε αυτό που διαπίστωσε όλη η ποδοσφαιρική Ελλάδα (χέρι πάνω στη γραμμή του ερυθρόλευκου τέρματος).
Σε κάθε περίπτωσή, ο 27χρονος Γιάννης Μανιάτης εξαργύρωσε την προσφορά του στους πρωταθλητές Ελλάδας με ένα νέο συμβόλαιο τετραετούς διάρκειας το οποίο θα τον «δένει» με την ομάδα του λιμανιού ως το 2017.«Η ΠΑΕ Ολυμπιακός ανακοινώνει την επέκταση της συνεργασίας της με τον Γιάννη Μανιάτη μέχρι το 2017» ανέφερε η σχετική ανακοίνωση της ερυθρόλευκης ποδοσφαιρικής εταιρείας, ενώ ο ποδοσφαιριστής δήλωσε:
«Είμαι περήφανος που αγωνίζομαι σε αυτή την ομάδα, που είναι πάνω από όλα οικογένεια και χαρούμενος που θα συνεχίσω να φοράω την ερυθρόλευκη. Θα δώσω όλες μου τις δυνάμεις για να καταφέρουμε τους στόχους της ομάδας, για να συνεχίσουμε να βρισκόμαστε σε τροχιά τίτλων και επιτυχιών και κυρίως για να κάνουμε τον κόσμο μας, διαρκώς, υπερήφανο και χαρούμενο».
