Ποινική δίωξη σε βαθμό κακουργήματος σε βάρος στελεχών της ΤΡΑΙΝΟΣΕ ασκήθηκε από την Εισαγγελία Πρωτοδικών Αθηνών.
Η δίωξη συνδέεται με το αδίκημα απιστίας στην υπηρεσία, τελεσθείσας κατ’ εξακολούθηση και αφορά την εκμίσθωση από την ΤΡΑΙΝΟΣΕ ακινήτων που δεν είχαν μεταβιβαστεί σε αυτήν με κανένα νόμιμο τρόπο από τον ΟΣΕ, και μάλιστα αντί ευτελούς τιμήματος.

Η υπόθεση εκτιμάται ότι προκάλεσε ζημιά στον ΟΣΕ από την απώλεια μισθωμάτων κατά τουλάχιστον 3 εκατομμύρια ευρώ.

Η εισαγγελικη έρευνα αφορά στα έτη 2006, 2007 και 2008.
Το καθεστώς δεν εχει πάντως μεταβληθεί: τα επίμαχα ακίνητα εξακολουθούν μέχρι και σήμερα να είναι μισθωμένα.